Các loài Colletotrichum spp. khác nhau gây ra bệnh thán thư có thể tồn tại trong cây cỏ dại và cây hoang dã. Chúng có thể là mầm bệnh trên các cây hoang dại hoặc được ghi nhận là sống nội sinh trên các cây này. Mối quan hệ giữa các chủng nấm Colletotrichum nội sinh và gây bệnh của cùng một loại thực vật cần được nghiên cứu nhiều hơn vì một số nấm nội sinh có thể là mầm bệnh tiềm ẩn.

Sau đây là 1 vài ví dụ về Các loài Colletotrichum spp. khác nhau gây ra bệnh thán thư trên cây trồng có thể tồn tại trên cây cỏ dại:

- Sự tồn tại của C. sublineola có khả năng lây nhiễm cho cây cao lương trồng trọt được cho là xảy ra thông qua sự lây nhiễm của các loài cao lương hoang dã như johnsongrass (Sorghum halapense).

Hình 1. Cỏ johnsongrass (Sorghum halapense)

- Trên cà chua, cỏ dại có thể phục vụ như là kí chủ thay thế cho nấm C. coccodes bằng cách hoạt động như một nguồn bệnh đầu tiên và thứ yếu.

- Berrie & Burgess (2003) đã báo cáo về 35 loài cỏ dại đã được điều tra và được phát hiện bị nhiễm C. acutatum trong các thử nghiệm và cũng có thể truyền bệnh cho cây dâu tây. Loại nấm này có thể tồn tại trong các mảnh vụn cỏ dại bị nhiễm bệnh trên bề mặt đất trong một mùa hè.

- Các loài Colletotrichum được báo cáo là mầm bệnh trên cây cỏ Xanthium spp. (một loại cỏ dại độc hại phổ biến trên đồng cỏ và cây trồng, ví dụ: cây bông vải, đậu tương, linh lăng) là C. dematium, C. cocodes và C. truncatum. Như đã biết, các loài C. dematium, C. cocodes và C. truncatum đều được ghi nhận là mầm bệnh trên cây trồng, nên trong trường hợp này, cây cỏ Xanthium spp. trên đồng ruộng được coi là nguồn lưu tồn của các nấm bệnh trên. 

- Ngoài ra, Colletotrichum spinosum được phân lập từ loài cỏ ké đầu ngựa Xanthium spinosum (bathurst burr, spiny cocklebur, Asteraceae). Colletotrichum spinosum (như tên trước đây được cho là C. orbiculare) cũng đã được tìm thấy là mầm bệnh trên Citrullus lanatus var. lanatus (thuộc họ Bầu- Bí- Dưa: Cucurbitaceae), Eucalyptus cinerea (thuộc họ Myrtaceae) và hai loài Acacia spp. (thuộc họ Mimosaceae). Ngoài ra, còn gây thối quả dưa gang, dưa leo, táo, lê và cà chua.

Hình 2. Cỏ ké đầu ngựa Xanthium spinosum (bathurst burr, spiny cocklebur, Asteraceae).

 - Nấm C. truncatum (syn. C. capsici) (tác nhân gây bệnh thán thư trên nhiều cây trồng họ Cà- Ớt) có khả năng xâm nhiễm và tồn tại trên 3 loài cỏ dại là cỏ sắt/ Dạ hương ngưu  (Vernonia cinerea), cỏ cứt heo (Ageratum conyzoides) và hoa ban ngày Bengal (Commelina benghalensis) hoàn toàn không tạo nên triệu chứng cho đến 8 tuần sau khi chủng bệnh. 

- Bệnh thán thư dâu tây do Colletotrichum spp. gây ra được coi là một trong những căn bệnh nghiêm trọng và phá hoại nhất đối với cây dâu tây trên toàn thế giới. Cỏ dại, là vật chủ tiềm tàng của tác nhân gây bệnh, có thể đóng vai trò là ổ chứa mầm bệnh tiềm tàng. Các nhà kho học báo cáo rằng các chủng C. nymphaeae phân lập có nguồn gốc từ các cây cỏ dại không triệu chứng (Amaranthus viridis L., Convolvulus arvensis L., Fumaria officinalis L., Lactuca serriola L. và Sonchus oleraceus L.) có khả năng gây bệnh trên cây dâu tây, điều này chứng tỏ rằng cỏ dại trên ruộng dâu tây có thể đóng vai trò là ổ chứa mầm bệnh. Tuy nhiên, các nghiên cứu sâu hơn là cần thiết để định lượng sự đóng góp thực sự của chúng đối với dịch bệnh thán thư trên các cánh đồng dâu tây.

Hình 3. Cỏ sắt/ Dạ hương ngưu  (Vernonia cinerea)

Tóm lại, Colletotrichum có thể sống và lưu tồn theo hình thức kí sinh gây bệnh hoặc nội sinh (xâm nhiễm nhưng không tạo ra triệu chứng) bên trên các loài cây cỏ dại và hoang dã trong khu vực canh tác, ở thời điểm đang hoặc sau mùa vụ trồng trọt. Chúng có thể sẽ là nguồn lây nhiễm cho cây trồng khỏe mạnh hoặc cho cây trồng ở mùa vụ mới. Do đó, quản lý cỏ dại cũng là một phần trong chiến lược quản lý các bệnh hại do nấm Colletotrichum trên cây trồng.